启动香精香料喷雾干燥机前应进行必要的准备工作。 
首先检查各个装置的轴承和密封部分连接处有无松动，各个机械部件的润滑油状况以及各个水、风、浆管阀口等是否处于所需位置。然后接通电源检查电压和仪表是否正常，香精香料喷雾干燥机，后检查料浆搅拌桶内料浆的量以及浓度等情况，若出现问题应及时排除。 
随后依次开启送风机、抽风机，低温真空喷雾干燥机，接着打开加热开关开始升温。当出料口温度达到设定温度时(一般为130℃左右)，启动料泵和除尘系统。当泵压达到2MPa后，打开喷枪开始造粒。喷雾干燥机运行后，应及时观察雾化情况及料泵工作状况，若出现堵枪现象需立即清洗或更换喷嘴。 
喷雾干燥机正常运行后，还应定时收料、定时检查各系统运行情况，记录各工艺参数，并注意清理振动过滤筛。 
工作结束时，应首先关停加热装置，停止燃气机运行。然后关闭喷枪阀门，更换喷枪，拧下喷嘴并冲洗干净。当进口温度减低到100℃以下后可以停止送风机和抽风机的运行。接着清理干燥塔和除尘器内余料，关闭除尘器及气锤，后关闭总电源，完成生产操作。如遇紧急情况，必须立即关停喷雾干燥机，应首先关停送风机和料泵。如果突遇停电，应拉出燃气机，使塔体自然降温，然后打开排污阀，排尽料浆管道内浆料，并清洗喷雾干燥机。 
喷雾干燥机长时间运行或因操作不当，部分喷雾干燥机内会出现集料而影响正常运行，此时需停止工作进行清洗。对于干燥塔内集料的清理，应打开清扫门，香精香料喷雾干燥机，用长把扫帚扫除漏斗形底部集料，打开出料阀，用自来水冲洗塔内。旋风分离器内集尘的清除，同样需要打开旋风分离器，用扫帚清扫集料，必要时也需用水冲洗。对于袋式除尘器的清理，应打开控制开关，连续敲打，然后打开清洗门，敲打布袋除尘器，后更换过滤袋。对于料浆管路系统的清理，应打开双向过滤器的排污阀，清洗过滤器滤网和管路，然后打开料泵，以水代料，清洗泵管、稳压包及管道。经过一段时间(一般600h左右)的运转，需对喷雾造粒干燥机进行必要的检查与养护。对于供料系统，应检查过滤器、管道、阀门、喷嘴等，看有无堵塞，定时清洗，检查喷嘴磨损情况以便及时更换。应检查料泵是否漏油，打压是否正常，油位是否正常等。对于风机，应查看轴和轴承是否缺油发热，有无震动、噪音等，必要时清洗风叶和对风叶做平衡校对。对于加热器，应检查热管是否正常，必要时清洗油管、油泵、油嘴三处的过滤网。另外，还应留意各电动机有无发热、振动、异声等情况，控制柜的仪表和电器工作是否正常等。